中国水产科学研究院鲤遗传育种工程技术研究中心（以下简称中心）依托中国水产科学研究院黑龙江水产研究所“鲤鲫遗传育种创新团队”和“淡水鱼类基因组学与基因编辑创新团队”，于2021年11月经中国水产科学研究院批准成立，是院属13个工程中心之一。工程中心现有固定工作人员18名，其中研究员6人、副研究员4人、助理研究员6人、研究实习员2人；流动人员23人。

自成立以来，先后承担国家重点研发计划、国家大宗淡水鱼产业技术体系、黑龙江省自然科学基金团队项目、中国水产科学研究院科技创新团队项目等多项研究任务。获国家原种和良种审定委员会审定通过的鲤新品种2个（镜鲤“龙科11号”和鲤“龙科12号”），年推广示范苗种3亿尾以上。

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